蚌埠市传染病医院始建于1953年，是省内建院最早、规模少有的市级传染病专科医院，在皖北乃至整个淮海经济区治疗35种国家法定传染病专科医院中，占有十分重要地位。医院设有肝科、肺科、急性传染病科、皮肤、性病科，同时，蚌埠市还将结核病防治所、皮肤性病诊疗中心、中西医结合肝病研究所、肝硬化研究所设在该院，使科研和临床治疗紧密地结合在一起。
蚌埠市传染病医院现有高级技术人员14名，中级技术人员54名，在读研究生2 名，在诊治各型肝炎、肝硬化、肺结核 、流脑、乙脑、狂犬病、伤寒、各种性病和疑难传染病，特别是在治疗重症肝炎、肝硬化、小儿肝炎、难治性肺结核、性病等方面有独特疗法，肝炎、肺结核治愈率、危重病人抢救成功率达到国内先进水平。
96年以来，蚌埠市传染病医院先后选派20多名个性中青年医务人员赴北京解放军302医院、上海瑞金医院、上海皮肤性病研究所、浙医大附院、安医附院等省、部级医疗单位进修学习，同时，投入数百万元购置了全自动生化分析仪、血液透析仪、腹水超滤机等检测和治疗设备。开展了肝硬化的药物研究、乙肝抗病毒组合药物临床对照研究、脂肪肝降脂方剂遴选应用以及人工肝支持系统治疗重症肝炎等科研项目，其中人工肝支持疗法治疗重症肝炎填补了安徽省空白，使重症肝炎患者治愈率大大提高。
蚌埠市传染病医院投资2600万元，新建了建筑面积达15200m2的现代化病房大楼及辅助设施，现已投入使用，新大楼可容纳病床330张，病房内设有中央空调、中央供氧、中央吸痰、电视、电话、传呼对讲、壁橱、卫生间、淋浴等，各项设施齐全。我们将以低廉的价格、一流的技术全方位地为患者提供更加优质的服务。